Kegiatan ekstrakurikuler Karate di SD Negeri 3 Kendari menjadi wadah bagi peserta didik untuk mengembangkan kemampuan bela diri sekaligus membentuk karakter yang disiplin, percaya diri, tangguh, dan sportif. Latihan dilakukan secara terarah untuk meningkatkan keterampilan, kebugaran jasmani, serta memberikan kesempatan kepada peserta didik untuk mengembangkan potensi dan meraih prestasi dalam berbagai kompetisi.